В слове "водоём", ВОД является корнем, О - интерфикс, ЁМ - корень, нулевое окончание. Основой слова является ВОДОЁМ. Слово "водоём" является именем существительным, мужского рода, неодушевлённое, второе склонение. Пример: Самый глубокий водоём - это Байкал.