Для того, чтобы определить корень в слове "корабли", необходимо подобрать однокоренные слова. Однокоренные слова к слову корабли: кораблевождение, кораблестроение, кораблик, кораблекрушение. Выделим неизменяемую часть во всех однокоренных словах. Это часть "корабл". В слове корабли — корень "корабл".